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Un des outils utilisés en nanotechnologie est le microscope à effet tunnel, parce qu'il permet d'observer la matière à l'échelle nanométrique et également de la manipuler à l'échelle nanométrique. Alors, pour bien comprendre comment fonctionne le microscope à effet tunnel, on va parler d'un principe qui est purement quantique, qui est l'effet tunnel, sur lequel est basé le fonctionnement de ce microscope.